Molti malware modificano spesso l'associazione dei file EXE all'interno della shell Windows, disabilitando o prendendo il controllo della loro esecuzione. In questi casi il ripristino del sistema si presenta particolarmente difficile, poiché tutti i programmi antivirus partono proprio da un file EXE. FixExe è un piccolo programma che ristabilisce la corretta associazione dei file EXE con la shell di Windows. La sua particolarità è rappresentata fal fatto che si tratta di un file con estensione .COM. Quindi eseguibile anche in quei sistemi dove non è possibile o non è sicuro lanciare file con estensione .EXE.